水手服忍者是一部动作片，時は安土桃山時代。忍びの郷を抜けた篠(17)は、追手から逃走する際に2015年にタイムスリップしてしまう。 たった一人で見知らぬ現代を彷徨う篠を救ったのは、篠そっくりの顔をした篠の子孫の服部優花(17)だった。 人として、生きる事の大切さを現代で学ぶ篠。 しかし、相良忍軍の頭である丸目蔵人佐の執拗な追跡に会い、壮絶な死闘が始まる。
